PDB-Datei (was es ist und wie man eine öffnet)

Inhaltsverzeichnis:

PDB-Datei (was es ist und wie man eine öffnet)
PDB-Datei (was es ist und wie man eine öffnet)
Anonim

Was man wissen sollte

  • Einige PDB-Dateien sind Programmdatenbankdateien.
  • Öffne eines mit einem Texteditor oder einem Programm wie Geneious.
  • Konvertieren Sie in ein anderes Format mit demselben Programm, das Ihre spezifische Datenbankdatei öffnet.

Dieser Artikel erklärt, was eine PDB-Datei ist, wie man sie öffnet und wie man sie in ein anderes Format konvertiert.

Was ist eine PDB-Datei?

Eine Datei mit der PDB-Dateierweiterung ist höchstwahrscheinlich eine Programmdatenbankdatei, die zum Speichern von Debugging-Informationen über ein Programm oder Modul verwendet wird, wie eine DLL- oder EXE-Datei. Sie werden manchmal auch Symboldateien genannt.

Die Datei bildet verschiedene Komponenten und Anweisungen im Quellcode auf ihr fertig kompiliertes Produkt ab, das der Debugger dann verwenden kann, um die Quelldatei und die Stelle in der ausführbaren Datei zu finden, an der er den Debugging-Prozess stoppen sollte.

Einige PDB-Dateien können stattdessen im Protein Data Bank-Dateiformat vorliegen. Dies sind reine Textdateien, die Koordinaten bezüglich Proteinstrukturen speichern.

Andere PDB-Dateien können im Dateiformat Palm Database oder PalmDOC erstellt und mit dem mobilen Betriebssystem PalmOS verwendet werden; Einige Dateien in diesem Format verwenden stattdessen die Dateierweiterung. PRC. Ein weiteres Format, das dieselbe Erweiterung verwendet, ist Tanida Demo Builder.

Image
Image

Wie man eine PDB-Datei öffnet

Verschiedene Programme verwenden ihre eigene PDB-Datei, um Daten in einem strukturierten Datenbankformat zu speichern, sodass jede Anwendung zum Öffnen ihres eigenen Typs verwendet wird.

Geneious, Quicken, Visual Studio und Pegasus sind nur einige Beispiele für Programme, die die Datei als Datenbankdatei verwenden könnten. Radare und PDBparse könnten auch funktionieren.

Einige PDB-Dateien werden als reiner Text gespeichert, wie die Program Debug Database-Dateien von Geneious, und sind vollständig für Menschen lesbar, wenn sie in einem Texteditor geöffnet werden. Sie können diese Art von PDB-Datei mit jedem Programm öffnen, das Textdokumente lesen kann, wie das integrierte Notepad-Programm in Windows. Einige andere kompatible Viewer und Editoren sind Notepad++ und Brackets.

Andere PDB-Dateien sind keine Textdokumente und nur nützlich, wenn sie mit dem Programm geöffnet werden, für das sie vorgesehen sind. Wenn Ihre beispielsweise in irgendeiner Weise mit Quicken verwandt ist, versuchen Sie, diese Software zu verwenden, um sie anzuzeigen oder zu bearbeiten. Visual Studio erwartet, dass eine PDB-Datei im selben Ordner wie die DLL- oder EXE-Datei angezeigt wird.

Mit Avogadro können Sie Protein Data Bank-Dateien in Windows, Linux und macOS anzeigen und bearbeiten. Diese Programme können die Datei auch öffnen: Jmol, RasMol, QuickPDB und USCF Chimera. Da es sich um einfachen Text handelt, können Sie ihn auch in einem Texteditor öffnen.

Palm Desktop sollte in der Lage sein, diese Datei zu öffnen, wenn sie im Palm Database-Dateiformat vorliegt, aber Sie müssen sie möglicherweise zuerst umbenennen, damit das Programm sie mit der PRC-Dateierweiterung erkennt. Calibre ist eine weitere Option.

Um eine PalmDOC-PDB-Datei zu öffnen, versuchen Sie STDU Viewer.

Tanida Demo Builder öffnet Dateien in diesem Format.

So konvertieren Sie eine PDB-Datei

Programmdatenbankdateien können höchstwahrscheinlich nicht in ein anderes Dateiformat konvertiert werden, zumindest nicht mit einem normalen Dateikonverter-Tool. Wenn es stattdessen eine Anwendung gibt, die diese Art von Datei konvertieren kann, ist es dasselbe Programm, das sie öffnen kann.

Wenn Sie beispielsweise Ihre Datenbankdatei von Quicken konvertieren müssen, versuchen Sie es mit diesem Programm. Diese Art der Konvertierung ist jedoch wahrscheinlich nicht nur wenig nützlich, sondern wird in diesen Datenbankanwendungen auch nicht unterstützt (d. h. Sie müssen diese Art von PDB-Datei wahrscheinlich nicht in ein anderes Format konvertieren).

Proteindatenbankdateien können mit MeshLab in andere Formate konvertiert werden. Dazu müssen Sie es möglicherweise zuerst mit PyMOL aus dem File > Bild speichern unter > VRML in WRL konvertieren -Menü, importieren Sie dann die WRL-Datei in MeshLab und verwenden Sie das File > Export Mesh As-Menü, um die PDB-Datei letztendlich in zu konvertieren STL oder ein anderes Dateiformat.

Wenn Sie das Modell nicht in Farbe benötigen, können Sie die Datei mit USCF Chimera direkt in STL exportieren (der Download-Link ist oben). Andernfalls können Sie dieselbe Methode wie oben (mit MeshLab) verwenden, um PDB mit USCF Chimera in WRL zu konvertieren und dann WRL mit MeshLab in STL zu exportieren.

PDB in PDF oder EPUB umzuwandeln, wenn Sie eine PalmDOC-Datei haben, ist auf verschiedene Arten möglich, aber am einfachsten ist es wahrscheinlich, einen Online-Konverter wie Zamzar zu verwenden. Sie können Ihre Datei auf diese Website hochladen, um sie in diese Formate sowie in AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT und andere eBook-Dateiformate konvertieren zu können.

Die Konvertierung in das FASTA-Format kann mit dem Online-PDB-zu-FASTA-Konverter von Meiler Lab erfolgen.

Es ist auch möglich, diese Datei mit PDBx/mmCIF online im CIF-Format (Crystallographic Information Format) zu speichern.

Kann es immer noch nicht öffnen?

Dateien, die sich mit keinem der obigen Tools öffnen lassen, sind wahrscheinlich keine PDB-Dateien. Was passieren könnte, ist, dass Sie die Dateierweiterung falsch lesen; Einige Formate verwenden ein Suffix, das PDB sehr ähnlich ist, wenn sie wirklich nichts miteinander zu tun haben und nicht gleich funktionieren.

Zum Beispiel ist eine PDF-Datei eine Dokumentdatei, aber die meisten der oben genannten Programme geben den Text und/oder die Bilder nicht korrekt wieder, wenn Sie versuchen, sie mit diesen Softwareprogrammen zu öffnen. Dasselbe gilt für andere Dateien mit ähnlich geschriebenen Dateierweiterungen, wie DBF-, DB-, ADP-, PD-, PDE-, PDC-, PDO- und WPD-Dateien.

PBD ist ein weiteres Programm, das zum EaseUS Todo Backup-Programm gehört und daher nur nützlich ist, wenn es mit dieser Software geöffnet wird.

Wenn Sie keine PDB-Datei haben, suchen Sie nach der Dateierweiterung Ihrer Datei, damit Sie das entsprechende Programm zum Öffnen oder Konvertieren finden können.

Erweitertes Lesen von PDB-Dateien

Sie können viel mehr über Programmdatenbankdateien von GitHub und Wintellect lesen.

Es gibt auch mehr über Protein Data Bank-Dateien zu erfahren; siehe Worldwide Protein Data Bank und RCSB PDB.

Häufig gestellte Fragen

  • Wie behebe ich das Problem, wenn Visual Studio PDB-Dateien nicht finden oder öffnen kann? Wenn eine Meldung angezeigt wird, dass Visual Studio die PDB-Datei nicht finden oder öffnen kann, versuchen Sie es mit dem Debugging-Tool von Visual Studio. Gehen Sie zu Tools > Optionen > Debugging > Symbole und select Microsoft Symbol Servers
  • Wie öffne ich eine PDB-Datei auf Android? Um eine PDB-Datei auf Android zu öffnen, verwenden Sie einen Dateileser eines Drittanbieters. Laden Sie die Cool Reader-App oder einen anderen PDB-Datei-unterstützten Reader von Google Play herunter.

Empfohlen: